As parcerias do Centro Universitário FEI com as empresas são normalmente realizadas por intermédio do IPEI. Ao ser procurado por uma empresa para a realização de uma parceria, o IPEI busca pelas competências necessárias entre os docentes e pesquisadores do Centro Universitário FEI. Existindo as condições necessárias para o estabelecimento da parceria, o IPEI auxilia na preparação da proposta de colaboração e no contrato a ser firmado entre as partes, realizando posteriormente a gestão do projeto e dos recursos financeiros envolvidos.